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센터는 ‘명품 선박 및 해양플랜트 미래 핵심기술 개발과 응용’이라는 최종 목표를 달성하기 위해 3개의 위원회와 3개의 연구그룹 및 3개의 지원팀을 구성 운영한다.
센터장은 연구센터의 대표자이며, 연구센터 운영을 총괄하고 부센터장은 센터장을 보좌하여 센터 연구그룹을 관리한다. 행정실장은 센터장을 보좌하여 센터 행정, 회계, 연구기획 및 지원을 담당한다. 또 각종 위원회와 연구그룹 및 팀을 구성해 센터의 연구활동을 효과적으로 수행한다. 위원회와 연구그룹 및 3개 팀의 기능과 역할은 다음과 같다.


평가/자문위원회
본 연구센터와 협력관계에 있는 산업체, 부산광역시, 국공립 연구소, 관공 서 및 학계를 대표하는 10인 내외로 구성된다. 위원장은 참여 외부기관 위원 중에 선임하고, 센터장과 부센터장이 참석한다. 위원회의 기능과 임무는 다음과 같다.
센터의 연구 실적과 운영에 대한 평가
연구방향 및 주요 추진전략에 대한 자문
산학연 협력, 연구기금조성 및 기술이전에 관한 자문
기타 센터 운영, 기획, 평가 등에 대한 자문
연 2회의 정기회의를 개최하고 위원장 또는 센터장의 요청에 의해 임시회의를 개최할 수 있다.

산학연통합운영위원회
센터 연구비의 장기 지원 기관에서 지정하는 대표 1인/기관, 센터장, 부센터장, 행정실장, 총괄과제 책임자로 구성한다. 그 기능과 임무는 산업체 지원과제 도출 및 선정, 개방형 제안(open proposals) 과제 도출 및 선정 등 센터의 산업체 지원 연구방향 설정과 제반 운영에 대한 의사결정을 한다.

센터운영위원회
센터장, 부센터장, 총괄과제 책임자, 핵심연구원 대표, 행정실장을 포함하는 8인 내외로 구성하며, 위원장은 센터장이 된다. 위원회의 기능과 임무는 다음과 같다.
연구재단 지원 센터 연구방향 설정과 제반 운영에 대한 의사 결정
센터 참여연구원의 교체 결정
각 부서간의 업무 분담, 관리 및 협력 사항 결의
평가위원회의 평가결과 및 자문위원회의 자문에 따른 후속 조치

핵심연구그룹
센터에서 수행하는 연구과제를 실제로 수행하는 부서로서 ‘에너지 효율향상 핵심기술 개발팀’, ‘핵심부품 소재 원천기술 개발팀’, ‘시스템 설계 및 성능 평가 핵심기술 개발팀’의 3개의 연구팀으로 구성되고, 각 연구팀은 총괄책임자, 세부책임자, 전임연구원, 산업체 연구원 및 석/박사 과정의 연구조원으로 구성된다. 팀장은 총괄과제 책임자로 한다.

컨소시움 과제 연구그룹
센터 참여기업에서 지원하는 과제 책임자 및 연구원을 지원 관리하고, 그룹장은 핵심 연구교수(PI) 중에서 1명이 맡는다.

개방형 제안과제 연구그룹
제안과제 연구책임자 및 연구원을 지원 관리하고, 그룹장은 핵심 연구교수(PI) 중에서 1명이 맡는다.

연구기획홍보부
팀장과 약간 명의 직원으로 구성하며, 아래의 업무를 수행한다.
산업체, 대학, 연구소와의 기술/인적 교류 관련 업무(심포지엄, 세미나 기획 및 조직, 해외연구자 유치활동)
발표자료 준비 및 홍보 활동(출판, web, 언론 등) 및 연차 보고서 및 E-newsletter 발간

시험시설관리팀 : 팀장과 약간 명의 직원으로 구성하며, 아래의 업무를 수행한다.
센터 장비/시설 관리
해외 연구자 연구지원 (신청서 번역, 접수 등)

행정지원팀
학교 지원 경리 관련 행정직원 팀장과 약간 명의 직원으로 구성하며, 아래의 업무를 수행한다.
센터 행정, 예산 집행, 구매 및 연구비 관리 등
     
부산광역시 금정구 부산대학로 63번길 2(장전동) 조선해양플랜트글로벌핵심연구센터
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